二手離子色譜系統(tǒng)的構(gòu)成與HPLC相同，儀器由流動相傳送部分、分離柱、檢測器和數(shù)據(jù)處理4個部分組成，在需要抑制背景電導(dǎo)的情況下通常還配有MSM或類似抑制器。其主要不同之處是IC的流動相要求耐酸堿腐蝕以及在可與水互溶的有機溶劑（如乙腈、甲醇和丙酮等）中不溶脹的系統(tǒng)。因此，凡是流動相通過的管道、閥門、泵、柱子及接頭等均不宜用不銹鋼材料，而是用耐酸堿腐蝕的PEEK材料的全塑IC系統(tǒng)。離子色譜的重要的部件是分離柱。柱管材料應(yīng)是惰性的，一般均在室溫下使用。柱和殊性能分離柱的研制成功，是離子色譜迅速發(fā)展的關(guān)鍵。
離子色譜的分離機理主要是離子交換，有3種分離方式，它們是離子交換色譜（HPIC）、離子排斥色譜（HPIEC）和離子對色譜（MPIC）。用于3種分離方式的柱填料的樹脂骨架基本都是苯乙烯-二乙烯基苯的共聚物，但樹脂的離子交換功能基和容量各不相同。HPIC用低容量的離子交換樹脂，HPIEC用高容量的樹脂，MPIC用不含離子交換基團的多孔樹脂。3種分離方式各基于不同分離機理。HPIC的分離機理主要是離子交換，HPIEC主要為離子排斥，而MPIC則是主要基于吸附和離子對的形成。
二手離子色譜系統(tǒng)的信號控制是指利用色譜工作站的硬件和軟件系統(tǒng)可以輸出前面提出的三種控制信號，根據(jù)被控儀器的要求，編制程序文件，適時輸出控制信號，使各儀器間達到同步運行的目的一種控制方式。
二手離子色譜系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)控制是近幾年來發(fā)展快的一種方式，也是將來發(fā)展的趨勢。隨著網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的飛速發(fā)展，變得越來越小，各儀器公司之間，各行業(yè)之間的交流越來越多。使用局域網(wǎng)的連接方式除了可以方便地對多臺離子色譜儀實施控制，更主要的是可以利用網(wǎng)絡(luò)的點將數(shù)據(jù)、信息、資料等直接傳輸?shù)骄W(wǎng)絡(luò)上，為數(shù)據(jù)格式的統(tǒng)一化，資源的共享化提供了技術(shù)保證。
